Visi, Misi dan Tujuan FMIPA merupakan turunan dari Visi UNJ, yaitu “Menjadi Universitas Bereputasi di Kawasan Asia” dan Misi UNJ yaitu: “Menyelenggarakan tridharma perguruan tinggi yang unggul dan berguna bagi kemaslahatan manusia”. Dari Visi dan Misi UNJ selanjutkan dirumuskan Visi, Misi, Tujuan dan Strategi FMIPA UNJ sbb:
Visi FMIPA UNJ 2017-2030
“Menjadi fakultas yang unggul dan memiliki daya saing dalam bidang MIPA dan pendidikan MIPA di tingkat Asia berlandaskan iman dan taqwa.”
Misi FMIPA UNJ
- Menyelenggarakan kegiatan pendidikan dan pengajaran yang bermutu dengan memanfaatkan teknologi informasi dan komunikasi untuk menghasilkan lulusan yang sesuai dengan kebutuhan stakeholder dan mampu bersaing di tingkat ASIA.
- Menciptakan suasana akademik yang kondusif, menciptakan suasana religius dalam setiap kegiatan akademik dan non akademik, dan menumbuhkan kemampuan berwirausaha bagi para mahasiswa.
- Menyelenggarakan kegiatan penelitian dan pengembangan bidang MIPA dan pendidikan MIPA sejalan dengan perkembangan ilmu dan teknologi.
- Menyelenggarakan kegiatan pengabdian pada masyarakat baik yang terkait dengan bidang MIPA dan pendidikan MIPA.
- Menjalin dan mengembangkan kerjasama dengan berbagai institusi baik di dalam maupun di luar negeri.