Universitas menyediakan fasilitas kesehatan untuk mahasiswa, yaitu dengan adanya Klinik Pratama yang berada di Gedung Fakultas Ilmu Pendidikan. Klinik ini diperuntukkan kepada seluruh mahasiswa UNJ dan akan dikenakan biaya sebesar Rp5.000,00. pada saat registrasi. Klinik Pratama UNJ menyediakan pelayanan kesehatan umum (Poli Umum) dan pelayanan kesehatan gigi (Poli Gigi). Mahasiswa dapat melakukan konsultasi dan obat dengan dikenakan biaya Rp5.000,00. Informasi layanan dan biaya lainnya dapat diakses melalui http://klinikpratama.unj.ac.id/kpms